Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms