Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 GDNF-202ENST00000344622 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 TTC39B-206ENST00000507285 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 PIP-201ENST00000291009 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 INSL5-201ENST00000304526 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL390760.1-201ENST00000366188 410 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 MED15P9-201ENST00000424716 533 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RBMY2JP-201ENST00000425544 1059 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LINC01049-201ENST00000426840 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RPS21P1-201ENST00000434479 247 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 OR5G3-201ENST00000435756 929 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 PHBP4-201ENST00000437447 837 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC108039.2-201ENST00000440214 359 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RN7SL58P-201ENST00000473445 294 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RN7SL563P-201ENST00000481233 298 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AMTN-202ENST00000504451 761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC006120.1-201ENST00000579375 546 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC110603.1-201ENST00000580645 468 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC080112.3-201ENST00000612552 880 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 MIR6726-201ENST00000613751 61 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL359745.1-201ENST00000626943 760 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ENSA-215ENST00000638926 360 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LINC02511-201ENST00000505736 1668 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 GPR19-201ENST00000332427 1743 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LINC00310-204ENST00000430922 2086 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.1 ms