Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FAM3AP98173 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms