Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 PBRM1-208ENST00000410007 4905 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 OR4D9-203ENST00000641962 6123 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 NLGN4X-201ENST00000275857 5454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 FCRL5-201ENST00000361835 5390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 SEMA6D-206ENST00000389428 5874 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 CUL4A-212ENST00000617546 5666 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC112719.2-201ENST00000501239 1685 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 FKBP14-201ENST00000222803 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 SVEP1-202ENST00000374469 12194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 ZNF252P-201ENST00000426361 5210 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 DIDO1-206ENST00000395340 7551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AKAP12-202ENST00000354675 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 WDFY2-201ENST00000298125 9321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CENPFP49454 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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CENPFP49454 TCF20-202ENST00000359486 7410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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CENPFP49454 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 MYOCD-203ENST00000425538 8466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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CENPFP49454 FRMPD2-201ENST00000305531 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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CENPFP49454 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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CENPFP49454 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 GAS7-204ENST00000437099 8003 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CENPFP49454 CTNND1-208ENST00000428599 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 CTNND1-232ENST00000532649 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 CTNND1-237ENST00000534579 6024 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 TBC1D15-217ENST00000550746 6184 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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