Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HOXD13P35453 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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HOXD13P35453 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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HOXD13P35453 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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HOXD13P35453 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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HOXD13P35453 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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HOXD13P35453 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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HOXD13P35453 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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