Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC084024.1-201ENST00000476186 621 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 ENPP7P3-201ENST00000509123 241 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC026979.2-201ENST00000523733 583 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 ZNF473-209ENST00000601364 603 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 ASPH-204ENST00000389204 1290 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 LINC01747-201ENST00000437696 1067 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 CHCHD7-205ENST00000517933 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC105202.1-203ENST00000518024 875 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC024451.4-201ENST00000602578 752 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 CLIC4P3-201ENST00000422221 752 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 RN7SL91P-201ENST00000469313 291 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms