Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ZAN-204ENST00000546292 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ACP6-205ENST00000583509 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CSNK1A1-201ENST00000261798 6067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ZNF845-202ENST00000595091 4413 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 HIVEP3-202ENST00000372584 12319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CPM-211ENST00000551568 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SPATA31D3-201ENST00000445385 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CCNT2-202ENST00000295238 4491 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 MYO7B-203ENST00000428314 6715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PDPR-201ENST00000288050 9255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ITGA11-202ENST00000423218 10192 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 DOCK11-202ENST00000276204 6664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 MYLK-205ENST00000360772 10027 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 NAIP-201ENST00000194097 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CEP41-201ENST00000223208 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 TECTA-202ENST00000392793 7426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ATG2B-202ENST00000359933 13684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ENPEP-201ENST00000265162 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SCRN1-206ENST00000426154 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CALN1-202ENST00000395275 9459 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 KIAA1671-202ENST00000401395 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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