Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 GCSHP1-201ENST00000512554 484 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CREM-216ENST00000429130 1476 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 EEF1A1P26-201ENST00000458319 1363 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 IL31RA-207ENST00000490985 2414 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC091304.1-202ENST00000568624 3100 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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HOXA3O43365 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL772337.3-201ENST00000447524 452 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RHEBP1-201ENST00000448647 556 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 PTMAP1-205ENST00000455552 325 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC108120.1-201ENST00000506543 991 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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