Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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