Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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