Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCSER1Q9C0I3 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCSER1Q9C0I3 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCSER1Q9C0I3 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCSER1Q9C0I3 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCSER1Q9C0I3 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCSER1Q9C0I3 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
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