Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms