Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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CCDC96Q2M329 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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CCDC96Q2M329 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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CCDC96Q2M329 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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CCDC96Q2M329 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
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CCDC96Q2M329 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
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CCDC96Q2M329 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
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