Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 SVIL-201ENST00000355867 7586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 SALL1-201ENST00000251020 5146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 RGMA-201ENST00000329082 11350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 NOTCH2-207ENST00000602566 5046 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 SAR1A-205ENST00000373242 5981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 PDE11A-201ENST00000286063 9275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 DISP1-201ENST00000284476 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 KLHL3-207ENST00000506491 6566 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ZMYND8-217ENST00000536340 5273 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ATP8A2-204ENST00000381655 9575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 KNG1-201ENST00000265023 3435 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 LTBP1-201ENST00000402934 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 BTBD3-202ENST00000378226 4904 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 NWD1-205ENST00000549814 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 MTAP-201ENST00000380172 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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