Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CNTNAP4-202ENST00000377504 4723 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LONRF2-201ENST00000393437 13912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC01226-208ENST00000640623 5019 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PLXNA3-201ENST00000369682 10885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RGS5-215ENST00000439699 1441 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PAX6-231ENST00000606377 6901 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MUC22-201ENST00000561890 6019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL513548.2-201ENST00000602994 1207 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC105046.1-201ENST00000566457 4997 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TNFAIP8-204ENST00000503646 2502 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SYNJ2-201ENST00000355585 7378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CAMSAP2-202ENST00000358823 7352 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RNF139-AS1-201ENST00000499418 5654 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC073842.2-201ENST00000494221 572 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 BTN3A3-201ENST00000244519 3002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 GNB5-201ENST00000261837 8906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ZNF585A-205ENST00000588354 596 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ZNHIT6-202ENST00000431532 6080 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 GPR179-203ENST00000616987 7980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ZNF441-201ENST00000357901 4356 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ESRG-201ENST00000583516 3140 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms