Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms