Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.9 ms