Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC073896.2-202ENST00000549860 437 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 FAM205C-203ENST00000603640 1017 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AL591686.2-201ENST00000608241 475 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 PGM5P3-AS1-202ENST00000442069 615 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 LINC01638-202ENST00000444114 637 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 STARD13-IT1-201ENST00000456087 452 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 CHCHD2P7-201ENST00000508008 452 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 LINC01146-206ENST00000556684 361 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC027271.1-201ENST00000610270 610 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 LINC01108-202ENST00000635227 776 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms