Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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HOXD10P28358 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC116631.1-202ENST00000640984 683 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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HOXD10P28358 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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HOXD10P28358 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
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HOXD10P28358 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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