Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 AC078955.1-201ENST00000547123 882 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 GPM6A-202ENST00000393658 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 RGS5-215ENST00000439699 1441 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 ADAM3A-205ENST00000481351 2379 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SFTPCP11686 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms