Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 ZNF214-201ENST00000278314 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 LINC02535-201ENST00000455071 2513 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AQP4-AS1-202ENST00000578701 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC009117.3-201ENST00000568136 543 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC025162.2-201ENST00000619602 560 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AL096816.1-201ENST00000623300 2920 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 PSG6-201ENST00000187910 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 ZNF846-202ENST00000586293 1621 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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RFXAPO00287 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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RFXAPO00287 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 VN2R1P-201ENST00000449668 1743 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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