Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 CT45A3-202ENST00000598716 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRRM4A7MD48 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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