Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SERP1Q9Y6X1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms