Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG4BQ9Y4P1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms