Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF3AQ9Y496 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms