Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC5Q9UQL6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms