Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD1BQ9UPS6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms