Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PHF8Q9UPP1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms