Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX6Q9UNH7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX6Q9UNH7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms