Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX12Q9UMY4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX12Q9UMY4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms