Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4EQ9ULY5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms