Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42EP3Q9UKI2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP3Q9UKI2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms