Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSKSQ9UJT2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms