Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEFF2Q9UIK5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms