Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VPS51Q9UID3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS51Q9UID3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS51Q9UID3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS51Q9UID3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS51Q9UID3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms