Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX20Q9UHI6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms