Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPC1L1Q9UHC9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms