Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CFDP1Q9UEE9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CFDP1Q9UEE9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms