Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms