Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP35Q9P2H5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
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