Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN3Q9P1Z3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms