Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP5Q9NZZ3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms