Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CMTM6Q9NX76 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms