Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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