Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC4BQ9NT99 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms