Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SALL1Q9NSC2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms