Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TM7SF3Q9NS93 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms