Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
DUOX1Q9NRD9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOX1Q9NRD9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms