Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGRNQ9NPE2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms