Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNRC6CQ9HCJ0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms